Різні варіанти імунних білків ловлять новий коронавірус з різною ефективністю.
Імунітет у різних людей працює по-різному, іноді імунні відмінності між нами можуть бути незначними, а іноді - дуже сильними, залежно від того, які варіанти імунних генів нам дісталися. Реакція на новий коронавірус теж може залежати від імунно-генетичних відмінностей, а саме від того, які у кого є варіанти генів HLA, або людських лейкоцитарних антигенів, або білків головного комплексу гістосумісності.
Бєлков HLA є кілька різновидів. Білки HLA першого класу сидять на поверхні майже всіх наших клітин, крім еритроцитів. Вони не просто сидять на поверхні - вони тримають фрагменти інших білків, які є в клітці. Спеціальні ферментні машини під назвою протеасоми постійно розщеплюють непотрібні і дефектні білки, і ось деякі фрагменти-пептиди вирушають до мембранних HLA. Імунні клітини, стикаючись з іншими клітинами, в першу чергу звертають увагу на те, що тримають їх білки HLA, і якщо HLA тримають звичайні білки, то імунітет залишається спокійним. Тобто HLA - це щось на зразок паспортної системи.
Якщо ж у клітці з'явилася інфекція, то з нею з'являться і чужорідні білки. Деякі їхні молекули теж потраплять в розщеплювальну машину протеасоми, і вирушать до білків HLA. І тут, як можна здогадатися, імунітет вже повз не пройде: імунні клітини відчують, що виставлено назовні з хворої клітини, і почнуть атаку.
У генів HLA першого класу є кілька варіантів, і вони добре вивчені, тобто ми знаємо, як влаштовані і чим відрізняються різні варіанти білків. Очевидно, ефективність імунного захисту від інфекції залежить в тому числі від того, наскільки добре білки HLA показують імунним клітинам чужорідні молекули. Якщо HLA погано утримує, наприклад, шматок вірусного білка, то імунітет не відразу дізнається, що в організмі оселився вірус. Можна припустити, що різні варіанти білків HLA по-різному поводяться з коронавірусними білками.
Дослідники з Орегонського університету охорони здоров'я проаналізували, як зв'язуються різні білки HLA з білками декількох коронавірусів; найбільшу увагу, природно, приділяли новому коронавірусу SARS-CoV-2. І дійсно, деякі варіанти HLA-білків погано пов'язували пептиди, які могли б утворюватися при розщепленні білків SARS-CoV-2. Які варіанти HLA добре пов'язують вірусні пептиди, а які - погано, автори роботи пишуть у статті в Journal of Virology.
Можна припустити, що людина, у якої в ДНК закодований той варіант HLA, який погано пов'язує вірусні пептиди, більш беззахисний перед вірусом і буде гірше переносити інфекцію - адже імунітет буде пропускати заражені вірусом клітини, і вірус зможе більш ефективно розмножуватися.
Однак тут треба уточнити, що дослідники аналізували HLA і вірусні пептиди в комп'ютерних моделях, в яких поєднували добре вивчені структури HLA-білків з вірусними пептидами, розраховуючи, чи добре вони зв'язуються. Швидше за все, і в живій клітці вони ведуть себе також, але щоб з упевненістю говорити про те, як це позначається на хворобі в цілому, варто проаналізувати гени HLA у справжніх хворих і порівняти їх гени з клінічною картиною.
Втім, зовсім не виключено, що перебіг коронавірусної інфекції дійсно залежить не тільки від статі, віку та обміну речовин, а й від ось таких молекулярно-генетичних особливостей.