Деякі ссавці дають можливість коронавірусам придбати нові властивості - серед таких «генетичних лабораторій» є і домашні свині.
Коронавірусів на світі є досить багато, і більшість з них вражає звірів і птахів. Власне, найнебезпечніші людські коронавіруси, SARS-CoV, MERS-CoV і SARS-CoV-2, прийшли до нас від тварин. Будучи в змозі жити у кількох господарів, вони в якийсь момент опинилися в людині. І виявилося, що в нас вони можуть цілком успішно розмножуватися, поступово все сильніше пристосовуючись до людського організму. При цьому, якщо взяти новий коронавірус SARS-CoV-2, здатність заражати інших тварин у нього не зникла. Минулої осені ми писали, що SARS-CoV-2 з різним успіхом може заражати цілий ряд видів ссавців, від леопардів і панд до корів, собак і овець.
Але, як ми сказали, коронавірусів багато. Чи можна дізнатися, скільки тварин вони здатні вражати, і наскільки варто боятися того, що від них до нас прийдуть ще коронавіруси? Це спробували з'ясувати співробітники Ліверпульського університету. Вони порівняли кілька сотень коронавірусних геномів, що належать 92 видам коронавірусів (багато з видів існують в декількох штамах). Знаючи одного вірусного господаря, можна припустити, в кому цей вірус може жити ще. Очевидно, інший господар буде еволюційно близький першому, вони обидва будуть жити приблизно в однакових умовах і є приблизно одне і те ж.
З іншого боку, порівнявши гени двох вірусів, можна зрозуміти, наскільки відрізняються їхні господарі. У будь-якій групі вірусів є більш близькі і менш близькі види, і коронавіруси тут не виняток. Два близьких коронавіруси з великою ймовірністю можуть заражати один і той же вид тварин. Зрозуміло, подібний аналіз проробляють не вручну, а за допомогою витончених алгоритмів.
І ось алгоритми видали, що у кожного з коронавірусів є не менше дванадцяти господарів. Для дослідження взяли 876 видів звірів, серед яких 185 були відомими господарями для коронавірусів, а інші були цим господарям близькими родичами. Виявилося, що кожен із звірів може дати притулок не менше п'яти видам коронавірусів. Серед тварин є справжні «суперхозяєва»: наприклад, у малайській пальмовій куниці, або мусанзі, потенційно можуть селитися 32 види коронавірусів (нагадаємо, що SARS-CoV-2, який спричиняв спалах атипової пневмонії на початку 2000-х, прийшов до людей від мусангу); кажана великий підковонос здатна прихистити в собі 67 видів коронавірусів; панголін - 14 видів; у домашніх свинях - 121 вид.
Тварини, в яких здатні оселитися кілька видів коронавірусів або кілька штамів одного і того ж виду, стають генетичною лабораторією. Якщо в одну клітку проникнуть одночасно кілька різних споріднених вірусів, вони зможуть обмінятися генами, і в результаті з клітини вийдуть вірусні частинки з новими генетичними наборами і новими здібностями. Однією з нових здібностей цілком може стати здатність заражати людину.
У статті в Nature Communications сказано, що для нового людського коронавірусу SARS-CoV-2 потенційними господарями виглядають 126 видів ссавців. Серед них є такі, які можуть стати генетичною лабораторією, зокрема, в них можуть зустрітися SARS-CoV-2, з одного боку, і MERS-CoV і SARS-CoV, з іншого. MERS-CoV і SARS-CoV небезпечніше, ніж нинішній SARS-CoV-2; особливо з цієї трійці небезпечний MERS-CoV, що викликає близькосхідний респіраторний синдром: від нього помирають більше третини тих, хто заразився, проте заразитися їм складно. Але уявімо, що буде, якщо MERS-CoV запозичить гени якогось родича і посилить свою заразність.
Автори роботи зуміли визначити, які з коронавірусів найбільш схильні при зустрічі обмінюватися генетичним матеріалом, і хто зі звірів може цьому особливо посприяти. У списку, крім кількох кажанів, верблюдів та інших видів, опинилися і домашні свині (не дарма ж у них може жити 121 коронавірус). Зрозуміло, звідси не слід, що потрібно винищити всіх свиней на світі, просто за ними потрібно ретельніше стежити, ретельніше перевіряти на коронавірусні інфекції тощо.
Схоже дослідження автори роботи збираються виконати для коронавірусів і птахів; ймовірно, серед пернатих теж виявляться потенційні «генетичні лабораторії», з великою ймовірністю здатні породити нові варіанти вірусів. Але тут варто звернути увагу на слово «потенційні». Нові дані отримані за допомогою алгоритмів і вказують лише на можливий розвиток подій. З цих даних зовсім не випливає, що кожна, що попалася вам на шляху свиня або кажан доверху нашпигована небаченими коронавірусами, які тільки й чекають, щоб на вас накинутися.