Любителів шоколаду вищої якості стає все більше. Задовольнити їхні запити допоможе розшифровка геному одного з різновидів шоколадного дерева.
Criollo, представник сімейства шоколадних дерев (Theobroma cacao) - одне з найстаріших одомашнених рослин. Індіанці майя «приручили» його 3 000 років тому. Плоди Criollo - джерело олії какао найвищої якості, але виробники какао-бобів поки воліють йому гібриди, менш схильні до хвороб: якість продукції не настільки висока, доходи менші, зате врожай гарантовано високий.
Однак незабаром ситуація може змінитися. Розведення шоколадних дерев Criollo не тільки потенційно прибутковіше, але і приносить користь навколишньому середовищу - рослини прекрасно відчувають себе в тіні лісів, дозволяючи ґрунту відновитися і підтримуючи біорізноманіття. Та й споживачі все частіше віддають перевагу елітному шоколаду, що володіє багатьма якщо не цілющими, то корисними для самопочуття якостями. Головна біда рослини - грибкові захворювання і шкідливі комахи. Здолати їх допоможе розшифровка геному шоколадного дерева, якою займалися французькі фахівці з Міжнародного центру співробітництва у сфері агрономічних наук (CIRAD) разом з колегами з інших країн.
Criollo - самовпиливна рослина з високим ступенем гомозіготності, коли кожен ген присутній у двох ідентичних формах, що підвищує точність «прочитання» геному. Автори дослідження розшифрували 84% геному, виявивши 28 798 генів, які кодують білки. Велика їх частина - 88% - пов'язані з однією з десяти хромосом шоколадного дерева. Також виявлено мікро-РНК, які, ймовірно, регулюють експресію генів.
З'ясувалося, що тільки 20% геному складається з рухомих елементів, завдяки яким змінюється генетична послідовність. Результат - відносно проста еволюційна історія з точки зору структури геному.
Фахівців особливо цікавлять сімейства генів, що впливають на якість какао і опірність хворобам. Можливо, це дозволить «дізнатися» гени, які безпосередньо контролюють певні зміни, що важливо для здійснення програми більш масштабного розведення Criollo. Виявлено два типи генів, відповідальних за стійкість рослини до недуг. Подальші дослідження, можливо, дозволять уточнити їх призначення.
Дослідники також виявили гени, що відповідають за вироблення масла какао, яке надзвичайно високо цінується виробниками шоколаду, кондитерами, фармацевтами і косметологами. Під контролем цієї групи генів - не тільки кількість вироблюваної олії, але і її якість. «Упізнані» гени, пов'язані з виробленням флавоноїдів, природних антиоксидантів, терпеноїдів, гормонів, пігментів, ароматів. Є всі підстави вважати, що ці дані дозволять Criollo просунутися у фаворити шоколадного виробництва і піднімуть якість шоколаду на радість гурманам.