Крім генів і дієти, на склад мікрофлори впливають взаємини мікробів один з одним.
Ми знаємо, що кишкові бактерії впливають на обмін речовин, імунітет і мозок, що серед них є «бактерії ожиріння» і «бактерії худоби», що правильна мікрофлора - багато в чому запорука здоров'я. Але як забезпечити собі правильну мікрофлору? Бактерії впливають на імунітет, але й імунітет впливає на них, а імунітет, у свою чергу, залежить від генів. Значить, від них залежить і те, хто приживеться у нас в кишечнику, а хто не приживеться. Інший важливий фактор - дієта: можна харчуватися так, що перевагу отримають шкідливі мікроби, або ж намагатися їжею підтримувати різноманітність мікрофлори, присутність у ній корисних бактерій.
Але навіть з урахуванням генетики, дієти та інших факторів склад мікрофлори все одно може виявитися не тим, на який розраховували. Співробітники Університету Саймона Фрейзера, Інституту Карнегі та інших наукових центрів експериментували з дрозофілами, у яких теж є своя кишкова мікрофлора, хоча і набагато простіша, ніж у звірів. Генетично ідентичних мух вирощували в однакових умовах і годували однаковою їжею. Спочатку мухи були без бактерій, і їм разом з їжею згодовували однакові кількості відомих бактеріальних штамів. Можна було б очікувати, що мікрофлора у мух буде однаковою, однак, як говориться в PNAS, вона у них все-таки відрізнялася: якісь бактерії в однієї мухи приживалися, а в іншої немає, і навпаки. У тому, які бактерії залишаться в кишечнику, а які ні, є частка випадковості.
Дослідники спробували підібрати математичну модель, яка описувала б формування мікрофлори. У підсумку вони дійшли висновку, що тут відіграють роль фактори, які мають відношення до того, як бактерії взаємодіють один з одним, і які ми не цілком розуміємо. Наприклад, дві бактерії можуть в прямому сенсі полегшувати життя один одному: де живуть одні, легко оселяться й інші, причому взаємна вигода, можливо, цілком здатна переважити не надто відповідну дієту, якої дотримується господар.
Якщо врахувати, що наша мікрофлора складніша за мушину, то у нас взаємини між різновидами бактерій можуть відігравати ще більшу роль. І це потрібно враховувати, коли мова заходить про бактеріальну терапію, тобто про те, щоб лікувати ті чи інші хвороби, просто додаючи або видаляючи з мікрофлори ті чи інші види бактерій.