Хвороботворні мікроби еволюціонують з урахуванням досягнень людської цивілізації.
Бактерія Clostridium difficile - це одна з багатьох бактерій брудних рук, і найчастіше її можна підчепити в туалетах, ванних і лікарнях. Живучи в кишечнику, вона може викликати різні захворювання, від порівняно невинної діареї до перфорації кишечника і загального зараження крові.
Антибіотиками від неї не завжди вдається відбутися: по-перше, C. difficile формує суперечки, і в такому сплячому вигляді може перечекати курс лікування, по-друге, сама вона часом стає стійкою до антибіотиків. Нарешті, по-третє, відомо, що ймовірність інфекції C. difficile часто навіть зростає після курсу антибіотиків, оскільки антибіотики змінюють склад кишкової мікрофлори, знищуючи тих корисних мікробів, які могли б стримати небезпечні інфекції. Так що в цілому, враховуючи її поширеність, C. difficile - одна з найбільш неприємних бактерій, з якими доводиться мати справу сучасній медицині. І вона продовжує еволюціонувати, все більше пристосовуючись до людини.
Дослідники з Інституту Сенгера та інших наукових центрів порівняли гени 906 штамів C. difficile, взятих у людей і тварин - собак, свиней, коней тощо. Штами, як їм і належить, були схожі один на одного, проте серед них знайшлося два, в яких накопичилося стільки генетичних відмінностей, що вони ось-ось стануть новими окремими видами. Що саме по собі не новина: бактерії, як і інші живі істоти, весь час змінюються, правда, бактерії роблять це швидше за інших. Але в даному випадку авторам роботи вдалося визначити конкретні фактори, які підштовхують еволюцію C. difficile.
Особливо цікавим виявився один з видів клостридії, який процвітає в медичних установах: він попадається в 70% бактеріальних зразків, взятих у лікарняних пацієнтів. Цей штам виник близько 76000 років тому і до сьогоднішнього дня обзавівся мутаціями, які дозволяють йому особливо ефективно засвоювати вуглеводи і формувати суперечки, стійкі до дезінфікуючих речовин. Іншими словами, бактерія і справді легко може колонізувати лікарні, і особливо добре себе почуває, якщо господар сидить на вуглеводному раціоні. (Варто, напевно, уточнити, що мутації для засвоювання вуглеводів і проти дезінфікуючих речовин виникли все-таки не 76000 років тому, просто подальша доля штаму склалася так, що він вдало пристосувався до досягнень цивілізації.)
Те, що мікроб особливо любить вуглеводну дієту, вдалося показати в дослідах з мишами: тваринам вводили «лікарняний» штам C. difficile і садили їх на ту чи іншу дієту. У статті в Nature Genetics сказано, що бактерія найуспішніше діяла в кишечнику мишей, яких годували їжею з простими вуглеводами, на кшталт глюкози і фруктози. Очевидно, наша пристрасть до солодкого зіграла роль в еволюції C. difficile, так що якщо ми хочемо випередити мікробів в еволюційній гонці, потрібно не просто шукати нові антибіотики, але і враховувати наш власний спосіб життя, починаючи з дієти і закінчуючи тим, якими миючими засобами ми користуємося в побуті.