Більшість сучасних коней зобов'язана своїм походженням двом дуже старим породам - арабській чистокровній і туркменській.
Перші домашні коні з'явилися близько 6000 років тому, в західній частині Євразійського степу - великого степового регіону в центрі Євразії. Західна частина Євразійського степу - це територія України і захід Казахстану; саме тут дикі коні колись стали домашніми.
З тієї пори з ними сталося багато всього: людина намагалася зробити коня більш сильним, витривалим, швидким, розумним і щоб у неї був покладистий характер, і в кожному новому поколінні відбирав таких особин, які найбільше його влаштовували. З іншого боку, самі люди не сиділи на місці, і коні супроводжували їх у нескінченних міграціях, військових походах, торгових караванах тощо.
Дослідники з Віденського ветеринарного університету вирішили дізнатися, звідки взялися сучасні породи коней, яких існує великий натовп - адже навряд чи їхній родовід сходить прямо до тих доісторичних степів. Для цього записи з племінних книг, які в Європі почали вести з початку XVIII століття, порівняли з результатами генетичного аналізу статевої Y-хромосоми більш ніж у трьохсот шістдесяти коней з п'ятдесяти семи порід (тобто аналіз охоплював близько однієї п'ятої всіх існуючих на сьогодні порід коней).
Y-хромосома, як ми знаємо, передається тільки по батьківській лінії, і по ній можна досить глибоко простежити родовід самця - якщо в «ігреці» з'являється якась мутація, то вона перейде до всіх чоловічих нащадків батька-мутанта (зрозуміло, якщо мутація не завдає якоїсь шкоди - в такому випадку вона просто зникне з геному).
Порівнюючи генетичні зміни в Y-хромосомі у різних порід, можна зрозуміти, в якій спорідненості вони складаються один з одним і хто з них з'явився раніше, а хто пізніше. У статті в Current Biology автори роботи пишуть, що переважна більшість порід, для яких відновлювали родовід, сходять до одного предка, який жив близько 700 років тому, а геном їх представляє суміш двох різновидів: арабської чистокровної і туркменської. Арабська родом з Аравійського півострова, туркменська - з Центральної Азії. Деякі сучасні породи, на кшталт ахалтекінської і йомудської, теж називають туркменськими, однак та стара туркменська порода, про яку йдеться в дослідженні, до сьогоднішнього дня вже вимерла.
Про те, що і арабська, і туркменська породи багато в чому сформували вигляд нинішнього коня, було відомо давно, проте ніхто не припускав, що з них вийшли майже всі нинішні породи. Мабуть, коли вони потрапили в Європу, їх тут швидко оцінили, і надалі конезаводчики створювали нові різновиди саме на їх основі.
Однак, як ми сказали вище, деякі сучасні коні опинилися в досить далекій спорідненості по відношенню до інших, і серед таких далеких родичів автори роботи називають шетлендського поні, фіордський кінь і ісландський кінь. Їх еволюційна доля була іншою, і їх предки, мабуть, прийшли в Північну Європу з якихось інших місць - наприклад, про ісландських коней відомо, що вони з'явилися тут разом з першими поселенцями більше одинадцяти століть тому.