Гени SARS-CoV-2 доводять його природне походження.
Один з міфів, пов'язаних з новим коронавірусом - це його нібито штучне походження: начебто його створили в якійсь лабораторії, а потім випадково - або не випадково - випустили на волю. Мається на увазі, що SARS-CoV-2 повинен бути біологічною зброєю, тому він так стрімко поширюється по світу.
Якщо поставити себе на місце тих, хто хотів би зробити новий жахливий коронавірус, що б ми робили? По-перше, ми б взяли якийсь вже відомий коронавірус і спробували б його вдосконалити. Тут напрошуються два кандидати - SARS-CoV, який викликав спалах атипової пневмонії в 2002-2003 рр., і MERS-CoV, що викликає близькосхідний респіраторний синдром, від якого вмирають понад 30% хворих.
Ми писали, що у SARS-CoV-2 найближчим родичем виявився SARS-CoV, чому новий вірус так і назвали. Але це найближчий родич серед людських коронавірусів: у статті в Nature Medicine дослідники з Інституту Скриппса та інших наукових центрів пишуть, що новий вірус також надзвичайно схожий на коронавіруси, які можна знайти у кажанів і панголінів. Іншими словами, передбачувані розробники повинні були взяти за основу вірус у кажанів або панголінів - не дуже раціональний вибір, якщо врахувати, що під рукою був той же SARS-CoV.
З іншого боку, вдосконалюючи вірус, ми намагаємося зробити так, щоб він легше проникав у клітку. У випадку з коронавірусом це означає, що потрібно змінити його S-білок - той самий, який утворює навколо вірусу щось на зразок сонячної корони і який взаємодіє з поверхневими клітинними білками. (Зараз вже відомо, що SARS-CoV-2 взаємодіє на поверхні клітини з ангіотензинпревращающим ферментом 2, який допомагає регулювати кров'яний тиск, бере участь в імунних процесах і виконує ще ряд функцій.)
За допомогою спеціальних алгоритмів можна розрахувати, які мутації слід внести в ген білка S, щоб він взаємодіяв з клітинними білками і робив це добре. Однак якщо порівняти гени S-білків у SARS-CoV і SARS-CoV-2, то виявиться, що мутації, що відрізняють SARS-CoV-2 від SARS-CoV зовсім не ті, які пропонують алгоритми розрахунку. Іншими словами, SARS-CoV-2 виник в результаті природного відбору, який створює такі варіанти, що їх неможливо вгадати алгоритмами - принаймні, тими алгоритмами, якими ми зараз володіємо.
За словами авторів роботи, SARS-CoV-2 міг перейти від тварин до людей за двома сценаріями: або у нього ще під час перебування в тварин з'явилися необхідні зміни в молекулах, що дозволяють йому успішно впроваджуватися в клітини людини, або вірус ще в непатогенному вигляді встиг потрапити в людину і якось у ній виживав, поки у нього не з'явилися мутації, що дозволяють набагато більш ефективно заражати людські клітини.